哈尔滨工业大学：微系统与微结构制造教育部重点实验室、语言语音教育部-微软重点实验室 
　　哈尔滨工程大学：导航仪器教育部工程研究中心、超轻材料与表面技术教育部重点实验室、船舶控制工程教育部工程研究中心、船舶动力技术工程研究中心
　　东北林业大学：森林植物生态学教育部重点实验室、生物质材料科学与技术教育部重点实验室、林木遗传育种与生物技术重点实验室、东北油田盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室
　　东北农业大学：乳品科学教育部重点实验室
　　东北石油大学：提高油气采收率教育部重点实验室
　　哈尔滨医科大学：黑龙江省生物医药工程重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地、省部共建教育部生物医药工程重点实验、省部共建教育部心肌缺血机理与诊疗技术重点实验室
　　黑龙江大学：教育部人文社会科学百所重点研究基地俄语语言文学研究中心、功能无机材料化学省部共建教育部重点实验室，农业微生物技术省部共建教育部工程研究中心